История компании «Монастырский двор» началась в 2014 году с разработки рецептуры бездрожжевого хлеба. Тогда начинающий предприниматель и основатель компании Сергей Кузьминых столкнулся с тем, что на широком рынке совершенно отсутствует такой исконно русский продукт, как хлеб на закваске, без дрожжей. Большие хлебокомбинаты не могли и не могут до сих пор выпускать настоящий живой хлеб, полезный для здоровья. Начались поиски своего рецепта хлеба на закваске. Для этого Сергей обратился к старинным монастырским поваренным книгам, откуда и почерпнул много полезной информации. Но вся она оказалась практически не применима к современному промышленному производству. Тогда было решено адаптировать исконно русские рецептуры под требования нового времени. В результате, была разработана уникальная технология промышленного производства хлеба на специальной закваске, без добавления дрожжей и разрыхлителей. Такой хлеб был насыщеннее по вкусу и аромату, вкуснее и полезнее привычных покупателям сортов. В дальнейшем технология и рецептуры были запатентованы владельцем компании.

Для того, чтобы обеспечивать производство по-настоящему качественным сырьем, в 2020 году было принято решения развивать собственное сельскохозяйственное направление. На данный момент для изготовления хлеба, хлебобулочных и кондитерских изделий используется цельнозерновая мука разных видов и сортов собственного производства.